Diyanet İşleri Başkanlığının şikayetçi olması üzerine ‘Halkın bir kesiminin benimsediği dini değerleri alenen aşağıladığı' iddiasıyla savcılığa çağırılan Prof. Dr. Celal Şengör, İstanbul Adliyesi’ne giderek ifade vermişti.
Şengör ifadesinde “Ben bir bilim tarihçisiyim. Bilimin doğruları neyse onu söyledim. Halkın bir kesiminin inandığı değerleri aşağılamadım. Tüm suçlamaları reddediyorum” demişti.
Soruşturmayı yürüten savcı Şengör hakkında ‘kovuşturmaya yer yok’ kararı verdi.
Şengör’ün şu sözleri nedeniyle soruşturma başlatılmıştı:
''Onların hepsi masal. İbrahim diye bir adamın yaşadığı malum değil…Bütün bu söylenen kişiler tarihte yok. Bunların hepsi o üç tane kutsal kitap denilen aslında… Hayır ama bu önemli Suriye din geleneği Mezopotamya din geleneğinden türemiş bir yan branştır. Bizim bugün İbrahimi dinler dediğimiz işte Musevilik, Hristiyanlık, arkasından İslam yani Museviliğe bakıyorsun Musa peygamber diyorlar. O adamı da tarih bilmiyor. Yok öyle bir isim. Musevilerin kitabında bir Mısır’dan çıkış vardır meşhur. Yok öyle bir olay. Yani incelendi, yayınlandı.''